Томографию показано проводить при стойких болях, эпилепсии и других неврологических нарушениях. Метод незаменим при обследовании пациентов с подозрением на инсульт, используется для более четкой визуализации патологий, выявленных ранее на рентгенографии или компьютерной томографии. Улучшенное качество снимков, полученных при помощи магнитно-резонансной томографии, позволяет выявить все, даже самые малые очаги патологии, оценить стадию их развития, при необходимости - возможность проведения хирургического вмешательства. В процессе обследования не используется опасное рентгеновское излучение, что наиболее актуально при обследовании детей и проведение неоднократных повторных исследований для оценки темпа развития заболевания, отслеживания эффективности лечения.